Решилось довольно просто:
1. Качаем обновления "врукопашную"
2. Кладем все в распакованом виде в "C:\Program Files\DrWeb Enterprise Server\var\repository" по своим "полочкам"
3. В тех же самых папках находим файлики ".id" и в них меняем цифру на
бОльшую. Разумно будет там писАть дату в формате YYYYMMDD или даже
YYYYMMDDHHMM